PSG tidak dalam performa terbaik mereka tetapi Messi mencetak gol ke-13 klubnya musim ini untuk menjadikannya unggul 2-0.
Ekitike dan Mukiele kembali terlibat sebelum Messi menyelesaikannya.
Gol tersebut awalnya dianulir karena offside tetapi pemeriksaan VAR mensahkan gol tersebut.
"Kami kembali dari Piala Dunia sehingga sulit bagi para pemain untuk menemukan poin referensi mereka lagi," kata pelatih Christophe Galtier kepada penyiar Canal Plus dikutip dari AFP.
"Kami semua baru saja terbiasa bermain bersama lagi dan Anda bisa melihat kadang-kadang kami kekurangan beberapa koneksi antara para pemain yang lebih sering kami miliki sebelum Piala Dunia," tambah Galtier, yang mengakui bahwa ia demam selama pertandingan.
PSG memperpanjang keunggulan atas Lens. Itu adalah kekalahan liga ke-10 berturut-turut untuk Angers.
Sementara tim PSG asuhan Galtier memperpanjang keunggulan mereka di puncak klasemen saat Lens yang berada di posisi kedua ditahan imbang 2-2 di Strasbourg.
Rekor tak terkalahkan PSG musim ini telah berakhir dengan kekalahan tandang 3-1 di Lens pada Hari Tahun Baru.
Tetapi mereka bangkit kembali untuk menang 3-1 di markas kasta ketiga Chateauroux di Piala Prancis pada akhir pekan tanpa trio penyerang superstar mereka.
Lens menikmati musim yang bagus tetapi tidak bisa mengalahkan Strasbourg yang sedang berjuang, yang memainkan pertandingan pertama mereka sejak pemecatan pelatih Julien Stephan.
Alexis Claude-Maurice membuat Lens unggul di Alsace hanya untuk Sanjin Prcic menyamakan kedudukan sebelum Kevin Gameiro memberi Strasbourg keunggulan.
Pemain internasional Belgia Lois Openda kemudian mengubah skor menjadi 2-2 sebelum jeda, dan tidak ada gol lebih lanjut.
Marseille sekarang hanya dua poin di belakang Lens di tempat ketiga setelah menang 2-0 di Troyes, disegel berkat gol oleh Chancel Mbemba dan Jordan Veretout, yang terakhir menjadi anggota skuad Piala Dunia Prancis.
Rennes di posisi keempat kalah setelah dua orang dikeluarkan dari lapangan sebelum kebobolan di injury time untuk kalah 2-1 di Clermont.