Namun yang membedakan, buaya Irian berukuran lebih kecil dan memiliki warna lebih gelap dibanding buaya muara.

Sisik buaya Irian lebih besar jika dibandingkan sisik buaya lainnya.

Buaya Irian jantan panjangnya mencapai 3,3 meter, dan yang betina 2,6 meter.

Berbeda dengan buaya siam, buaya Irian bertelur saat musim kemarau. Sayangnya, telur buaya Irian terus dicari sehingga jumlah yang menetas sedikit.