Pengambilan gambar film ini secara resmi dimulai pada tanggal 16 November 2010 di New York City.
Film Men in Black 3 sudah memenangkan banyak penghargaan, satu di antaranya sebagai pemenang BMI film Music Award Kategori Film Music (Danny Elfman).
Men in Black 3 melanjutkan kisah dari film sebelumnya mengenai kehidupan agen di sebuah organisasi yang menangani alien, Men in Black (MIB).
Salah satu agen MIB, Agen K (Tommy Lee Jones) telah berkali-kali memasukkan alien ke penjara MIB.
Hal ini membuat Agen K menjadi incaran atau sasaran para alien yang berusaha memburunya.
Satu di antara alien yang memiliki dendam pada Agen K adalah alien dari ras Boglodite, Boris The Animal yang pernah ditangkap oleh Agen K bertahun-tahun lalu.
Menjadi seorang agen yang sering berhubungan dengan alien ganas dan kriminal dari berbagai planet adalah sebuah hal yang menjadi keseharian agen Men In Black (MIB).
Pada 2012, setelah dikurung selama 43 tahun dalam penjara MIB di Bulan, Boris berhasil kabur dan membunuh beberapa petugas keamanan.
Setelah membuat kacau Bulan dengan menghancurkan dinding penjara dari dalam, Boris bersumpah akan membalas dendam pada Agen K di Bumi.
Dia berhasil kabur dari selnya dengan membunuh beberapa petugas keamanan yang ditempatkan khusus untuk dirinya.
Dalam perjalanan ke sebuah bar, Agen J meminta jika suatu saat meninggal terlebih dahulu, maka Agen K harus memberikan pidato pemakaman yang lebih baik dari apa yang baru saja dilakukan Agen K.
Di tengah perdebatan, atasan keduanya, Agen O menugaskan mereka untuk menangani insiden keracunan yang terjadi di sebuah restoran.
Insiden ini melibatkan salah satu alien ilegal yang datang ke Bumi.
Saat melakukan investigasi, mereka menemukan bahwa Boris berhasil mendarat di Bumi.