- Habib Abdul Qodir bin Abdurrahman Assegaf (Ayah)
- Bustan binti Umar Al Katiri (Ibu)
Istri: Sayyidah binti Hasal Alhabsyi
Anak:
- Fatimah,
- Muhammad Bagir,
- Umar,
- Abu Bakar, dan
- Toha
Pendidikan Habib Syech bin Abdul Qodir Assegaf
Diketahui, pendidikan awal Habib Syech didapatkan dari ayah kandungnya, yang merupakan fondasi utama dalam pembentukan karakter dan pengetahuannya.
Selain itu, beliau juga mencari ilmu dan mengambil berkah spiritual melalui proses belajar dengan beberapa habaib ternama di Kota Surakarta, salah satunya adalah Habib Anis bin Alwi al-Habsyi.
Pengalaman ini tidak hanya memperkaya pengetahuan agamanya tetapi juga memperkuat keimanan dan spiritualitasnya.