- Penyebab: Adanya tuduhan kelompok islam radikal kepada kelompok Warsidi sehingga ada oknum yang melakukan pembantaian terhadap kelompok ini dan menewaskan setidaknya 130 orang.
- Penyelesaian: Menghasilkan sebuah deklarasi perdamaian untuk menghindari perkara di pengadilan.
e. Pembunuhan pejuang HAM Marsinah
- Hak yang dilanggar: Hak kebebasan menyampaikan pendapat dan kelangsungan hidup seseorang.
- Penyebab: Keterlibatan Marsinah dalam aksi memperjuangkan hak buruh sehingga beliau dianggap sebagai ancaman bagi oknum tertentu.
- Penyelesaian: Penangkapan para petinggi tempat Marsinah bekerja dan dihukum selang waktu 4 tahun hingga 17 tahun saja.
f. Penembakan buruh PT Freeport
- Hak yang dilanggar: Hak untuk melangsungkan hidup dengan nyaman.
- Penyebab: Sekelompok oknum yang menyerang secara brutal terhadap buruh PT Freeport saat di terminal bus gorong-gorong.
- Penyelesaian: Pidana hukuman mati bagi tersangka.
g. Tragedi Trisakti Tahun 1998
- Hak yang dilanggar: Hak bebas berpendapat oleh mahasiswa dan rakyat yang direnggut pemerintah.
- Penyebab: Adanya desakan dari mahasiswa untuk menggulingkan pemerintahan Soeharto.
- Penyelesaian: Sampai saat ini belum ada upaya penuntasan yang konkrit dari peristiwa ini.
h. Penculikan dan penghilangan orang secara paksa yakni 23 aktivis pada tahun 1998