"Kami memiliki momen yang bagus. Lawan bertahan dengan baik. Sangat penting untuk mendapatkan tiga poin hari ini," kata Musiala setelah pertandingan.
"Kami tidak harus memenangkan setiap pertandingan dengan empat atau lima gol. Terkadang 1-0 sudah cukup. Kami harus bersabar. Sekarang kami terus maju dan menatap pertandingan berikutnya."
Pelatih Bayern Vincent Kompany berkata: "Terkadang menang seperti ini itu bagus -- meskipun kami tentu lebih suka menang dengan selisih tiga atau empat."
"Saya tahu kami harus tetap sabar dan tenang. Kami melakukannya dengan baik. Itu adalah pertandingan yang bagus dan kemenangan yang bagus."
Tak terkalahkan di puncak klasemen Bundesliga di bawah asuhan Kompany, Bayern mengalami kesulitan di Liga Champions musim ini meski tampil gemilang pada laga pembuka melawan Zagreb.
Kekalahan 1-0 di Aston Villa dan kekalahan telak 4-1 oleh Barcelona yang tampil gemilang di bawah asuhan mantan bos Bayern Hansi Flick membuat juara Eropa enam kali itu melemah dalam format liga tunggal baru Liga Champions.
Dengan pertandingan tertunda 15 menit karena masalah transportasi umum dan para penggemar tuan rumah terdiam karena keadaan darurat medis di tribun, Bayern mengalami kesulitan.
Kapten Bayern Manuel Neuer mengatakan kepada wartawan bahwa timnya "tidak merayakan di kabin seperti biasanya" karena insiden tersebut.
Musiala dan Michael Olise menggiring bola dari kedua sisi sayap namun gagal menembus pertahanan Benfica yang berupaya bertahan dan memanfaatkan lini tinggi Bayern yang berisiko dalam serangan balik.
Peluang terbaik di babak pertama jatuh ke tangan Serge Gnabry, yang memaksa Anatoliy Trubin melakukan penyelamatan gemilang saat melepaskan tembakan setengah voli pada menit ke-38.
Seiring berjalannya pertandingan, Bayern makin gugup, meski Benfica hanya punya sedikit peluang nyata saat mereka mencari kemenangan pertama dalam pertandingan ke-11 melawan tuan rumah.
Leroy Sane menambah kecepatan setelah pergantiannya dan mantan pemain sayap Manchester City itu terbukti krusial, mengoper bola kepada Kane yang kemudian memberikan umpan kepada Musiala untuk memecah kebuntuan dengan hanya tersisa 20 menit.
Pertandingan terakhir Bayern sebelum jeda internasional berlangsung pada hari Sabtu di Hamburg melawan St Pauli.