Varian-varian Covid-19 yang Telah Terdeteksi, Berikut Perbedaan Omicron dengan Varian Lainnya
Varian-varian virus corona (Covid-19) yang telah terdeteksi dan diberi label VOC hingga VOI, berikut perbedaan varian baru Omicron dengan varian lain.
Penulis: Rica Agustina
Editor: Facundo Chrysnha Pradipha
TRIBUNNEWS.COM - Omicron adalah varian baru virus corona (Covid-19) yang paling cepat diberi label varian yang diwaspadai (variant of concern-VOC) oleh WHO.
Hal itu karena penyebaran varian Omicron tampak cepat di Afrika Selatan dan berpotensi melahirkan banyak mutasi yang mengganggu.
Kemunculan varian Omicron telah menyebabkan sejumlah negara melakukan pembatasan perjalanan, hingga tugas baru pembuat vaksin Covid-19 untuk mulai mengerjakan vaksin khusus strain ini.
Untuk diketahui, sampel pertama dari garis keturunan Omicron atau B.1.1.529 diambil pada 9 November, menurut WHO.
Sampel tersebut langsung mendapat perhatian karenamenyebabkan lonjakan kasus di Afrika Selatan.
Baca juga: Dua Pasien Varian Omicron Covid-19 di Sydney, Berasal dari Afrika Selatan dan Transit di Singapura
"Varian baru ini, B.1.1.529 tampaknya menyebar sangat cepat," kata Tulio de Oliveira, direktur Pusat Respons & Inovasi Epidemi Afrika Selatan, dan seorang peneliti genetika di Universitas Stellenbosch.
Selain itu, sekuensing genetik menunjukkan virus itu membawa sejumlah besar mutasi yang mengganggu pada protein lonjakan, yaitu struktur mirip tombol pada permukaan virus yang digunakannya untuk bergulat dengan sel yang diinfeksinya.
Beberapa dari mutasi tersebut telah dikenali dari varian lain dan diketahui membuatnya lebih berbahaya, termasuk yang disebut E484A, protein sistem kekebalan yang memiliki pertahanan garis depan dalam melawan infeksi dan yang membentuk dasar perawatan antibodi monoklonal.
Dikutip dari CNN, varian Omicron juga membawa mutasi yang disebut N501Y, yang memberi Alpha dan Gamma peningkatan transmisibilitas mereka.
Minggu lalu, Scott Weaver dari University of Texas Medical Branch dan rekan melaporkan dalam jurnal Nature bahwa mutasi khusus ini membuat virus lebih baik bereplikasi di saluran napas bagian atas, yaitu pada hidung dan tenggorokan, yang kemungkinan membuatnya lebih mungkin menyebar ketika orang bernapas, bersin dan batuk.
Seperti varian Delta, varian Omicron juga membawa mutasi yang disebut D614G, yang tampaknya membantu virus menempel lebih baik pada sel yang diinfeksinya.
"Jumlah mutasi itu sendiri tidak berarti bahwa varian baru akan menyebabkan masalah apa pun, meskipun mungkin membuatnya lebih terlihat berbeda dengan sistem kekebalan tubuh," kata dokter Peter English, mantan ketua Pengobatan Kesehatan Masyarakat Asosiasi Medis Inggris.
Yang mengkhawatirkan para ilmuwan adalah jumlah mutasi yang mempengaruhi protein lonjakan.
Itu karena sebagian besar vaksin terkemuka menargetkan protein lonjakan. Vaksin yang dibuat oleh Pfizer/BioNTech, Moderna, Johnson & Johnson, AstraZeneca, dan perusahaan lain semuanya hanya menggunakan potongan kecil atau urutan genetik virus dan bukan virus utuh, dan semuanya menggunakan potongan protein lonjakan untuk memperoleh kekebalan.
Jadi perubahan protein lonjakan yang membuatnya kurang dikenali oleh protein sistem kekebalan dan sel-sel yang dirangsang oleh vaksin akan menjadi masalah.
Baca juga: Daftar 17 Negara yang Mendeteksi Kasus Covid Omicron hingga Puluhan Negara yang Batasi WN Asing
Sejauh ini, tidak ada bukti bahwa ini telah terjadi tetapi tidak ada cara untuk mengetahuinya dengan melihat mutasi saja.
Para peneliti harus menunggu dan melihat apakah varian Omicron akan lebih banyak menyebabkan infeksi Covid-19 daripada varian lainnya.
Ketakutan lainnya adalah bahwa mutasi mungkin membantu membuat virus kurang rentan terhadap perawatan antibodi monoklonal.
Namun, WHO mengatakan kecil kemungkinan mutasi ini akan mempengaruhi pengobatan Covid-19 lainnya, termasuk obat antivirus yang sedang dikembangkan dan steroid deksametason.
Sejauh ini, varian Omicron telah terdeteksi di 17 negara, termasuk Afrika Selatan dan Botswana, dan di antara pelancong ke Belgia, Belanda, Australia, Kanada, Inggris, Italia, Israel, dan Austria, menurut database GISAID dan pejabat setempat.
Dibutuhkan lapisan pengujian ekstra di atas dan di luar tes standar untuk mendeteksi varian virus corona mana yang telah menginfeksi seseorang.
Sekuensing genetik harus dilakukan dan itu membutuhkan waktu lebih lama dari tes antigen cepat atau tes PCR.
Lebih lanjut, seorang dokter yang merawat beberapa pasien yang positif varian Omicron di Afrika Selatan mengatakan kepada Reuters bahwa pasiennya hanya memiliki gejala ringan.
"Keluhan klinis yang paling dominan adalah kelelahan yang parah selama satu atau dua hari, kemudian sakit kepala dan badan terasa sakit dan nyeri," kata dokter Angelique Coetzee, seorang praktisi swasta dan ketua Asosiasi Medis Afrika Selatan.
Tetapi para dokter setuju bahwa vaksinasi kemungkinan akan memberikan banyak perlindungan terhadap varian Omicron dan mendorong orang untuk divaksinasi jika mereka belum melakukannya.
Adapun di Afrika Selatan, kurang dari 24 persen total penduduknya, telah divaksinasi, di mana hanya 35 persen orang dewasa Afrika Selatan yang divaksinasi penuh, kata presiden negara itu, Cyril Ramaphosa, Minggu.
Dan Afrika Selatan memiliki banyak orang yang terinfeksi HIV, yang menekan sistem kekebalan, yang saat ini tidak dapat memperoleh pengobatan, dan yang mungkin lebih rentan terhadap infeksi.
Faktor-faktor tersebut dapat mempengaruhi munculnya varian di Afrika Selatan dibandingkan dengan negara-negara di mana lebih banyak orang divaksinasi dan lebih sedikit memiliki kondisi immunocompromising.
Sementara para ahli mengatakan mereka mengawasi dengan cermat, beberapa mengatakan mereka belum terlalu khawatir tentang varian Omicron.
"Saya tidak berpikir kita harus panik," Robert Garry, seorang profesor mikrobiologi dan imunologi di Fakultas Kedokteran Universitas Tulane
"Langit tidak runtuh. Kami belum melihat bukti bahwa Omicron menyebabkan penyakit yang lebih parah daripada varian lainnya," kata dokter Peter Hotez, dekan Fakultas Kedokteran Tropis di Baylor.
Informasi lebih jauh, sebelum varian Omicron, WHO telah menetapkan beberapa varian Covid-19 sebagai VOC, yang dinamai dengan huruf alfabet dalam bahasa Yunani. Berikut di antaranya.
VARIANTS OF CONCERN
Varian Delta
Varian Delta dari virus corona sekarang menjadi garis keturunan dominan di AS dan sebagian besar negara di dunia.
Varian Delta menyumbang 99,9 persen kasus di AS, menurut Pusat Pengendalian dan Pencegahan Penyakit AS.
Varian Delta yang juga dikenal sebagai B.1.617.2, jelas lebih menular daripada varian lain, tetapi masih belum jelas apakah itu menyebabkan penyakit yang lebih parah.
Varian yang pertama kali terdeteksi di India itu dengan cepat mengambil alih dari varian B.1.1.7, atau Alpha, di sebagian besar negara.
Varian Delta juga membawa sekelompok mutasi pada protein lonjakan, yang dapat menghindari sistem kekebalan, dan mungkin berarti orang yang pernah terinfeksi dengan varian sebelumnya lebih berpotensi untuk tertular lagi.
Varian Delta juga menghindari efek pengobatan antibodi monoklonal yang disebut bamlanivimab, yang dibuat oleh Eli Lilly and Company, tetapi rentan terhadap perlindungan yang ditawarkan oleh pengobatan antibodi monoklonal lainnya.
Baca juga: Daftar 11 Negara yang Dilarang Masuk Indonesia Terkait Adanya Covid-19 Varian Omicron
Varian Alpha
Varian Alpha pertama kali diidentifikasi sebagai VOC pada Desember lalu.
Varian yang juga dikenal dengan nama B.1.1.7 itu menyapu Inggris dengan cepat dan kemudian ke dunia, kemudian menjadi garis keturunan yang dominan di AS.
Varian Alpha sekarang sudah diturunkan menjadi 'variant being monitored' oleh CDC karena dampaknya yang rendah di AS.
Varian Alpha setidaknya 50 persen lebih menular daripada garis keturunan yang lebih tua.
Varian itu membawa 23 mutasi, termasuk satu yang disebut N501Y yang meningkatkan transmisi.
Varian itu sepenuhnya rentan terhadap perawatan dan vaksin antibodi monoklonal.
Varian Beta
Pertama kali terlihat di Afrika Selatan, varian B.1.351 atau Beta memiliki mutasi E484K yang terkait dengan pelepasan kekebalan dan mutasi N501Y yang diduga membantu membuat banyak varian lain lebih menular.
Telah terbukti 50 persen lebih mudah menular daripada strain yang lebih tua dan menghindari pengobatan antibodi monoklonal ganda Lilly, tetapi tidak pada yang lain.
Tes darah dan penggunaan kehidupan nyata keduanya menunjukkan bahwa varian itu dapat menginfeksi orang yang telah pulih dari virus corona dan juga orang yang telah divaksinasi.
Pembuat vaksin yang mencoba untuk keluar dari varian baru dengan mengembangkan suntikan booster berfokus pada B.1.351, karena varian ini yang paling ditakuti para ilmuwan.
Tetapi pelarian sebagian tidak berarti pelarian penuh, dan vaksin masih diharapkan untuk melindungi orang sampai tingkat tertentu.
Meski demikian, varian Delta tetap mendominasi di Afrika Selatan dan varian Beta tidak pernah mendapatkan banyak pijakan di AS, terlepas dari kekhawatiran yang ditimbulkannya.
Varian Beta sekarang ditunjuk sebagai 'variant being monitored' oleh CDC.
Baca juga: Fakta-fakta Omicron, Varian Baru Covid-19 yang Ditemukan di Afrika Selatan
Varian Gamma
Varian P.1 atau Gamma yang melanda Brasil juga tidak pernah mendapat banyak dukungan di tempat lain dan juga sekarang disebut sebagai 'variant being monitored' oleh CDC.
Varian Gamma membawa mutasi E484K dan N501Y, dengan lebih dari 30 mutasi lainnya.
Telah ditunjukkan untuk menghindari efek pengobatan antibodi monoklonal Lilly tetapi tidak yang dibuat oleh Regeneron.
Tes darah menunjukkan varian itu mungkin sebagian lolos dari respons imun alami dan yang ditimbulkan oleh vaksin.
VARIANTS OF INTEREST
Varian Lambda atau C.37 ditetapkan sebagai Varian Minat WHO pada bulan Juni, sedangkan CDC tidak menyebutkannya.
Varian Mu atau B.1.621 menimbulkan ketakutan yang berlebihan ketika dinyatakan sebagai variant of interets (VOI) oleh WHO pada bulan Agustus.
Namun sekarang, varian MU telah dikelompokkan ke dalam 'variant being monitored' oleh CDC
VARIANTS BEING MONITORED
Varian Epsilon atau B.1.427 dan B.1.429, pertama kali terlihat di California dan diketahui memiliki mutasi L452R yang sama yang dibawa oleh varian Delta, tetapi tidak sebagian dari mutasi lainnya dan tidak terjadi seperti yang dilakukan varian Delta.
Varian Iota atau B.1.526, pertama kali terlihat di New York pada November lalu.
Varian Iota menyebar pada awalnya, terhitung sebanyak 9 persen dari sampel April lalu, tetapi sekarang hampir menghilang.
Varian itu memiliki apa yang disebut mutasi 484 yang seharusnya membantu virus menempel lebih mudah ke sel yang diinfeksinya dan membuat virus kurang dikenali oleh sistem kekebalan tubuh.
Varian Eta yang pertama kali terlihat di Inggris dan Nigeria, juga dikenal sebagai B.1.525, membawa mutasi E484K dan disebut juga hampir menghilang.
Varian Zeta yang beredar di Brasil sejak tahun lalu, juga dikenal sebagai P.2.
Varian itu membawa mutasi E484K dan belum banyak ditemukan secara global, dan menurut CDC hampir menghilang dari AS.
Baca juga artikel lain terkait Virus Corona
(Tribunnews.com/Rica Agustina)