Ia kemudian pulang ke Indonesia pada tahun 1984. 

Bambang Subianto kemudian kembali bekerja di jurusan manajemen fakultas ekonomi UI (LMUI).

Pada tahun 1988, Bambang Subianto menjadi staff Menteri Keuangan sebagai Direktur Departemen Keuangan dan Akuntansi.

Tahun 1992, ia naik jabatan menjadi Dirjen Departemen Keuangan.

Di masa menjabat Dirjen ia aktif dalam mengembangkan berbagai hukum dan peraturan, termasuk hukum pasar modal (1995), Pengembalian selain pajak (1997), dan peraturan lainnya yang diperlukan oleh semua perusahaan di Indonesia yang menerapkan transparansi dengan mendaftarkan hasil audit laporan keuangan mereka pada perwakilan pemerintah yang berwenang dan membuat laporan yang terbuka untuk masyarakat.

Pada pertengahan krisis di bulan January 1998, Bambang Subianto diangkat menjadi Ketua Indonesian Bank Restructuring Agency (IBRA).

Kemudian bulan Mei 1998, ia menjabat sebagai Menteri Keuangan RI

(Kompas.com/Yohana Artha Uly)