Ketika yang lain beristirahat, Thomas melihat sebuah peradaban di kejauhan.

Thomas menemukan puluhan Cranks dirantai dan datang Brenda (Rosa Salazar), yang tinggal di sana dengan sekelompok yang selamat.

Sekelompok WCKD, dipimpin oleh Janson, menyerbu tempat tersebut.

Thomas dan Brenda, melarikan diri memisahkan diri dari Gladers yang lain.

Mereka berdua pergi dan menemukan semacam klub yang mempertemukan mereka dengan Marcus.

Dia tahu sesuatu tentang The Right Arm, tapi dia tidak memberi tahu Thomas dan Brenda tentang identitasnya.

Thomas dan Brenda telah menemukan Gladers yang lainnya, lalu Marcus memberi tahu mereka di mana mereka bisa menemukan The Right Arm.

Thomas berbicara dengan Teresa, dia mengatakan bahwa dia melihat ibunya marah dan itulah yang membuatnya tidak ingin menyerah dengan keadaan.

WCKD datang, dan Thomas berlari untuk memperingatkan yang lainnya.

Mereka bisa mengetahui tempat itu dikarenakan Teresa yang memanggil mereka dan memberi tahu mereka.

Ava dan Janson keluar, mereka bilang bahwa Teresa telah bergabung bersama WCKD sejak awal.

Janson hampir membunuh Thomas, namun Brenda berhasil menembaknya terlebih dulu.

Minho tertembak, Ava, Teresa, dan Janson melarikan diri dengan Minho ketika Thomas tak berdaya menyaksikan pesawat lepas landas.

Thomas mengumpulkan segala sisa kekuatannya dan memutuskan akan kembali menyusup WCKD, untuk menyelamatkan Minho, dan membunuh Ava.