Namun tidak semua kelahiran interseks disebabkan oleh variasi kromosom.

Dalam beberapa kasus, karakteristik jenis kelamin janin akan berubah jika kadar testosteron atau estrogen terlalu tinggi atau terlalu rendah.

Hal tersebut juga mungkin hasil dari genetika tetapi juga dapat disebabkan oleh kondisi medis, obat-obatan, atau racun yang mengganggu bagaimana hormon diproduksi atau diproses.

Baca juga: Faktor Penyebab Terjadinya Permasalahan Gender

Kategori Interseks

1. 46, XX Interseks

Kategori ini merupakan orang yang memiliki kromosom XX dan ovarium biasanya dianggap sebagai "perempuan" tetapi alat kelamin luar biasanya dianggap sebagai "laki-laki".

Hal ini paling sering disebabkan ketika janin perempuan terpapar hormon laki-laki berlebih sebelum lahir (seperti yang dapat terjadi jika ibu memiliki tumor hipofisis atau terpapar testosteron selama kehamilan).

2. 46, XY Interseks

Dalam kategori ini orang memiliki kromosom XY tetapi alat kelamin luar yang biasanya dianggap sebagai "perempuan".

Hal ini paling sering disebabkan rendahnya kadar testosteron yang mempengaruhi perkembangan organ seksual pria.

Mungkin juga karena kurangnya enzim yang digunakan untuk memproses testosteron.

3. Interseks Gonad Sejati

Interseks ini terjadi pada orang yang memiliki ovarium dan testis, baik dengan kromosom XX, kromosom XY, atau keduanya.

Penyebab sebagian besar kasus interseks gonad yang sebenarnya tidak diketahui, meskipun beberapa kasus dianggap sebagai akibat dari racun lingkungan.