Setelahnya, pada 2002, Benny Mamoto meraih gelar S2 Kajian Ilmu Kepolisian dari Universitas Indonesia (UI).

Ia kemudian meraih gelar S3 dari UI dengan ilmu yang sama.

Karier Benny Mamoto di kepolisian termasuk cemerlang.

Pada 2005, ia pernah dipercaya untuk memimpin operasi pembebasan sandera di Filipina oleh kelompok Abu Sayyaf, dilansir TribunJateng.com.

Benny diketahui pernah menjadi penyidik Detasemen Khusus (Densus) 88 Antiteror Polri.

Baca juga: Berbaju Dinas Lengkap, Nasib Bharada E Ditentukan Tiga Perwira Berpangkat Kombes

Selama menjadi penyidik Densus 88, ia kerap terlibat dalam operasi penggerebekan dan penyidikan terduga teroris.

Dilansir TribunManado.com, Benny pernah menyelidiki kasus bom di KBRI Paris hingga kasus teror di Pakistan.

Benny diketahui pernah menjabat sebagai Kepala Unit I/Keamanan Negara Separatis, Dit I Bareskrim Polri, Wakil Direktur II/Ekonomi dan Khusus Bareskrim Polri, hingga Wakil Sekretaris NCB-Interpol Indonesia.

Ia juga pernah berkarier di lingkungan pemerintahan dengan menjabat sebagai Direktur Badan Narkotika Nasional (BNN) pada 2009.

Tiga tahun setelahnya, ia menjabat sebagai Deputi Pemberantasan Narkotika BNN.

Jabatan itu menjadi jabatan terakhir Benny sebelum akhirnya pensiun pada 2013.

Selama berkarier di kepolisian, Benny meraih beberapa tanda jasa, di antaranya adalah:

- Satya Lencana Kesetiaan 8 tahun;

- Satya Lencana Kesetiaan 16 tahun;