Sutopo menikah dengan Retno Utami Yulianingsih SH dan dikaruniai empat orang anak.
Pada Januari 2018, Sutopo mengumumkan bahwa ia mengidap kanker paru-paru stadium IV dan masih berada di bawah tahap perawatan.
Baca: Pieter Bingung Mencari Tempat Tinggal Baru Setelah Anak-anaknya Tak Ingin Kembali ke Rumah di Petobo
Keluarga dan dokternya telah memintanya untuk berhenti beraktivitas, namun Sutopo menolaknya, meskipun sakit.
Karenanya ia juga terpaksa memakai morfin.
Sutopo juga masih tetap bersemangat dan tak pernah surut, terutama jika berbicara dengan wartawan.
Ia diketahui masih aktif memantau bencana di media sosial, menyediakan informasi, dalam berbagai kejadian, sepertia tenggelamnya KM Sinar Bangun dan gempa Lombok pada 2018.