Ia juga menjadi tenaga pengajar Kementrian Pendidikan dan Kebudayaan untuk masa tugas 2012-2040.
Pada 2007, Filep Wamafma menjabat sebagai Wakil Ketua Dua II STIH Manokwari Papua Barat.
Setahun kemudian, ia menjabat sebagai Wakil Ketua Satu I STIH Manokwari Papua Barat selama satu tahun.
Sebelum masuk ke dunia politik, ia menjadi anggota Devisi Hukum dan Humas Anggota Komisi Pemilihan Umum Provinsi Papua Barat pada 2009-2014.
Pada 2010, ia menjadi pelaksana Tugas KPU Kabupaten Tambrauw Komisi Pemilihan Umum Kabupaten Raja Ampat.
Ia pernah menjadi pelaksana Tugas Ketua STIH Manokwari Papua Barat pada 2014-2016 dan Ketua STIH Manokwari Papua Barat pada tahun 2015-2019.
Pada 2016, Filep Wamafma menjabat sebagai konsultan hukum KPU Kabupaten Raja Ampat selama satu tahun.
Baca juga: Daftar Nama Bakal Calon DPD RI Dapil Maluku di Pemilu 2024, Ada 4 Petahana dari Total 16 Orang
Pengalaman Organisasi
- Wakil Ketua Badan Eksekutif Mahasiswa STIH Manokwari (2002-2003)
- Sekretaris Dewan Adat Suku Biak Wilayah Manokwari (2006-2020)
- Ketua Panitia Perumus Peningkatan Status Yayasan Perguruan Tinggi Manokwari (2011-2014)
- Ketua Pembangunan Kampus STIH Manokwari Yayasan Perguruan Tinggi Manokwari (2012-2019)
- Wakil Ketua Asosiasi Perguruan Tinggi Swasta Wilayah B Papua Barat (2015-2018)
- Pembina Aliansi Mahasiswa Papua (2016-2018)