Gempa awal terjadi pada 14 April 2016 pukul 21:26 waktu setempat (15 April pukul 12:26 UTC).
Pusat gempa berada di barat laut Gunung Kinpu, 12 kilometer barat laut Kota Kumamoto.
Guncangan gempa terasa kuat di seantero Pulau Kyushu hingga sampai di Shimonoseki di Pulau Honshu dan Kota Kirishima di Prefektur Kagoshima.
Setelah gempa, tercatat sedikitnya 11 gempa susulan dengan kekuatan paling besar yaitu magnitudo 6.
Sedikitnya 9 orang tewas dan 1.000 orang luka-luka akibat gempa di saat awalnya.
Sementara, sekitar 40.000 orang di wilayah terdampak gempa dievakuasi ke tempat yang aman.
Dua hari setelahnya, 16 April 2016, gempa berkekuatan magnitudo 7.0 mengguncang Kumamoto untuk kedua kalinya pada pukul 01:25 waktu setempat (15 April 16:25 UTC).
Pusat gempa berada di wilayah Kota Kumamoto.
Baca juga: Gunung Aso di Kumamoto Jepang Meletus, 16 Pendaki Selamat Tak Ada yang Terluka
Guncangan gempa terasa hingga di Beppu, Prefektur Ōita dan di Busan, Korea Selatan.
Pada pukul 01:27 waktu setempat, peringatan bahaya tsunami diberlakukan untuk wilayah di sepanjang pesisir Laut Ariyake dan Laut Yatsushiro.
Dua jam setelahnya peringatan tsunami dicabut.
Pascagempa, kerusakan terjadi di beberapa wilayah di Kumamoto. 91.700 warga dievakuasi dari wilayah gempa.
Kerusakan infrastruktur dilaporkan terjadi di seluruh wilayah Kyushu; di antaranya banyak rumah di Kumamoto yang ambruk.
Lalu matinya jaringan air di Kumamoto.